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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado. |
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Data corrente: |
18/03/2021 |
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Data da última atualização: |
18/03/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROSSATTO, T.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N.; MILECH, C.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. |
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Afiliação: |
T. ROSSATTO, UFPEL; P. A. AULER, UFPEL; M. N. AMARAL, UFPEL; C. MILECH, UFPEL; ARIANO MARTINS DE MAGALHAES JUNIOR, CPACT; E. J. B. BRAGA, UFPEL. |
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Título: |
Selection of Reference Genes for RT-qPCR Studies in Different Organs of Rice Cultivar BRS AG Submitted to Recurrent Saline Stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Russian Journal of Plant Physiology, v. 68, n. 2, p. 254-265, 2021. |
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ISSN: |
1021-4437 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Quantitative real-time polymerase chain reactions (RT-qPCR) have become one of the most widely used methods for analyzing gene expression, provided suitable reference genes are available to normalize the data. RNA was isolated from leaves, grain, rachises and sheaths of rice (Oryza sativa L. cv. BRS AG) submitted to different saline stress events for seven days, and expression analysis was carried out by RT-qPCR. Expression levels of ten candidate reference genes were assessed, actin11 (ACT11), ubiquitin conjugating enzyme E2 (UBC-E2), eukaryotic elongation factor1-a (Eef-1a), glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), B-tubulin (B-Tub), eukaryotic initiation factor 4a (Eif-4-a), ubiquitin10 (UBQ10), ubiquitin5 (UBQ5), aquaporin TIP41 (TIP41-like). Gene expression stability was calculated using the common statistical algorithms geNorm, BestKeeper and ?Ct method, NormFinder and RefFinder. The most stably expressed genes were UBC2E and GAPDH for leaves, UBQ5 and UBQ10 for sheaths, TIP41 and UBQ10 for rachises, and TIP41 and cyclophilin for grain. Gene expression of triose phosphate translocator (TPT1), ADP-glucose transporter (BT1-1), choline monooxygenase (CMO) was used to validate the selected reference genes. The results highlighted the importance of using suitable reference gene to normalize gene expression data in rice plants. |
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Thesagro: |
Arroz; Gene; Oryza Sativa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/221965/1/Artigo-Selection-of-Reference-Genes.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Clima Temperado (CPACT) |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 1. |  | ADAMSKI, J. M.; DANIELOSKI, R.; DEUNER, S.; BRAGA, E. J. B.; CASTRO, L. A. S. de; PETERS, J. A. Responses to excess iron in sweet potato: impacts on growth, enzyme activities, mineral concentrations, and anatomy. Acta Physiologiae Plantarum, v. 34, n. 5, p. 1827-1836, September 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 2. | | ROSSATTO, T.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N.; MILECH, C.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Selection of Reference Genes for RT-qPCR Studies in Different Organs of Rice Cultivar BRS AG Submitted to Recurrent Saline Stress. Russian Journal of Plant Physiology, v. 68, n. 2, p. 254-265, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | RIBEIRO, M. V.; SERPA, D.; BRANDÃO, I. R.; KLEINOWSKI, A. M.; BARBIERI, R. L.; PETERS, J. A.; BRAGA, E. J. B. Multiplicação in vitro de maytenus ilicifolia Mart. ex Reiss.: Um grande avanço na propagação desta espécie. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 18.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 5., 2011, Joinville. Resumos... Itajaí: ABCTP / SBFP, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | BACARIN, M. A.; SCHMITZ, D. D.; FALQUETO, A. R.; CASSOL, D.; TORRES, A. C.; PETERS, J. A.; BRAGA, E. J. B. Características fotossintéticas de batata cv. Baronesa e seu genótipo transformado geneticamente para resistência ao PVY. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 26, n. 3, p. 383-387, jul./set. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 7. | | RIBEIRO, M. V.; RODRIGUES, I. C. da S.; BARBIERI, R. L.; MARIOT, M. P.; PETERS, J. A.; BIANCHI, V. J.; BRAGA, E. J. B. Estabelecimento in vitro de Espinheira-Santa oriundas do banco de germoplasma da Embrapa Clima Temperado, Pelotas, RS. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 6., 2008, Bagé. Revista Congrega URCAMP, Bagé, v. 4, n. 4, Não paginada , nov. 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | LIMA, T. S.; BARBOSA, L. M. P.; SILVA, M. M. da; BRAGA, E. J. B.; BIANCHI, V. J.; CASTRO, C. M.; NORA, L. Fotoperíodo e aeração no cultivo de raízes in vitro de diferentes genótipos de batata (Solanum spp.). In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 9., 2007, Pelotas. Pesquisa e responsabilidade ambiental: resumos expandidos ... Pelotas: UFPel: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, 2007. 01 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | RIBEIRO, M. V.; BIANCHI, V. J.; RODRIGUES, I. C. S.; MARIOT, M. P.; BARBIERI, R. L.; PETERS, J. A.; BRAGA, E. J. B. Diversidade genética entre acessos de espinheira-santa (Maytenus ilicifolia Mart. ex Reis.) coletados no estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Revista Brasileira de Plantas Medicinais, Botucatu, v. 12, n. 4, p. 443-451, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | BENITEZ, L. C.; PETERS, J. A.; BACARIN, M. A.; KOPP, M. M.; OLIVEIRA, A. C. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Tolerância à salinidade avaliada em genótipos de arroz cultivados in vitro. Revista Ceres, Viçosa, v. 57, n. 3, p. 330-337, mai./jun. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | SILVA, I. M. de C. da; SILVA, A. S. da; CUCHIARA, C. C.; RIBEIRO, M. de F.; DUTRA, L. F.; BRAGA, E. J. B.; PETERS, J. A. Uso da radiação gama na organogênese in vitro de pereira, CVS. carrick e ya-li. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 18.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 5., 2011, Joinville. Resumos... Itajaí: ABCTP / SBFP, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | BORELLA, J.; RODRIGUES, L. B. V.; MARTINS, A. C.; AMARANTE, L.; OLIVEIRA, D. dos S. C.; OLIVEIRA, A. C. B. de; BRAGA, E. J. B. Waterlogging-induced changes in carbohydrates of root soybean. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 15.; REUNIÓN ARGENTINA DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 30., 2014, Mar del Plata. Resúmenes... [Mar del Plata: Sociedad Argentina de Fisiología Vegetal, 2014].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | BORELLA, J.; COCCO, K. L. T.; DELIAS, D. dos S.; AMARANTE, L.; OLIVEIRA, D. dos S. C.; OLIVEIRA, A. C. B. de; BRAGA, E. J. B. Waterlogging-induced changes in fermentative metabolism of root soybean. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 15.; REUNIÓN ARGENTINA DE FISIOLOGÍA VEGETAL, 30., 2014, Mar del Plata. Resúmenes... [Mar del Plata: Sociedad Argentina de Fisiología Vegetal, 2014].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | OLIVEIRA, A. C. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; SILVEIRA, C. F.; BRAGA, E. J. B.; FONSECA, G. de M. da; BENITEZ, L. C.; MAIA, L. C. da; LUZ, V. K. da. Ácido abscísico e o estresse abiótico. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. 30 p. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 307).| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | POLETO, S. M.; BENITEZ, L. C.; AMARAL, M. N. do; VIGHI, I. L.; AULER, P. A.; RODRIGUES, G. dos S.; OLIVEIRA, A. C. de; MAIA, L. C. da; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Prospecção de normalizadores para estudos de expressão gênica de arroz em baixa temperatura. CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 9., 2015, Pelotas. Ciência e tecnologia para otimização da orizicultura: anais. Brasília, DF: Embrapa; Pelotas: Sosbai, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 16. | | BENITEZ, L. C. B.; VIGHI, I. L.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N. do; MORAES, G. P.; RODRIGUES, G. dos S.; MAIA, L. C. da; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Correlation of proline content and gene expression involved in the metabolism of this amino acid under abiotic stress. Acta Physiologiae Plantarum, v. 38, n. 11, p. 267-1-12, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 17. | | ROSSATTO, T.; AMARAL, M. N. do; BENITEZ, L. C.; VIGHI, I. L.; BRAGA, E. J. B.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MAIA, M. A. C.; PINTO, L. da S. Gene expression and activity of antioxidant enzymes in rice plants, cv. BRS AG, under saline stress. Physiology and Molecular Biology of Plants, v. 10, n. 38, p. 1-11, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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